משרד החקלאות ופיתוח הכפר הוא המשרד האחראי מטעם הממשלה על החקלאות והמרחב הכפרי. בין פעילויותיו העיקריות של המשרד: תכנון ופיתוח ההתיישבות, החקלאות והכפר, מתן שירותים וטרינריים, שימור קרקע וניקוז. המשרד משתף פעולה עם גופים ציבוריים, כמו מינהל מקרקעי ישראל והרשות הממשלתית למים ולביוב (לשעבר "נציבות המים").

נושאים בטיפול המשרד: אכיפה ופיקוח צומח וחי, תכנון ופיתוח הכפר, חקלאות אורגנית, חקלאות ירוקה, יבוא ויצוא, שיתוף והדרכת חקלאות בינלאומית, חקר שווקים בינלאומיים, עובדים זרים, שנת שמיטה, ועצים בוגרים בישראל.